Si gestionas un servidor web en el cual usas mysql, y de repente ves que te estás quedando sin espacio. Hay muchas razones que podrías revisar. Una de ellas es revisar si el mysql está generando ficheros bin los cuales tienen un tamaño cercano al Giga.
mysql-bin.000001
mysql-bin.000002
mysql-bin.000003
mysql-bin.000004
mysql-bin.000005
......
Estos archivos se generan cuando se tienes log-bin = mysql-bin o log-bin = línea en el archivo de configuración /etc/my.cnf
Estos ficheros en realidad, no siempre son necesarios, ya que sólo se utilizan en sistemas con replicación de mysql. Si este es tu caso, lo más fácil es comentar la línea log-bin = mysql-bin en /etc/my.cnf y borrar los ficheros ya generados.
Con esto se conseguirán varios gigas de espacio libre en el servidor.
Esta información se puede ver ampliada en http://systembash.com/content/mysql-binary-log-file-size-huge/